根据《个人所得税法》第四十六条的规定，个人申请专项附加扣除时，可以在纳税前扣除住房贷款利息支出。通过提供首套房贷款合同及相关证明材料，在填报个人所得税申报表时，可以申请专项附加扣除。同时，个人所得税法规定，无论是第一套房还是第二套房的住房贷款利息支出，均需要在购房合同或贷款合同上有明确记录房屋为自住房。以上只是一般情况下的规定，具体操作还需根据个人的实际情况、法律法规和国家政策进行申报和扣除。
根据《个人所得税法》第四十六条的规定，个人申请专项附加扣除时，可以在纳税前扣除住房贷款利息支出。对于拥有两套房的个人，其住房贷款利息的扣除方式如下：
1. 普通住房贷款：针对第一套房的住房贷款利息支出，可以在年度所得额中扣除，最高限额为每年12万元。通过提供首套房贷款合同及相关证明材料，在填报个人所得税申报表时，可以申请专项附加扣除。
2. 第二套住房贷款：对于第二套房的住房贷款利息支出，可以在纳税前扣除。通过提供第二套房贷款合同及相关证明材料，在年度所得额计算时可以直接减去该部分支出。
需要注意的是，对于第二套住房的住房公积金贷款利息等其他住房贷款利息支出，目前仍不能享受专项附加扣除。同时，个人所得税法规定，无论是第一套房还是第二套房的住房贷款利息支出，均需要在购房合同或贷款合同上有明确记录房屋为自住房。
以上只是一般情况下的规定，具体操作还需根据个人的实际情况、法律法规和国家政策进行申报和扣除。建议您在具体操作前咨询相关税务机关或专业人士，以确保所操作的方式合法有效。